- Rektoratsakten: Jahresablage und Schriftverkehr des Rektorats (1802-1990)
- Ehrenbücher der Universität: 3 Bände (1895-1986)
- Personalakten (über 13.000 Akten)
- Philosophische Fakultät (Phil. Fak.) 1766-1791, 1802-1814, 1818-1879/80, 1882/83-1974/75, 1976/77-2009/10
- Juridische Fakultät (Jur. Fak.) 1809-2004/05
- Sozial- und Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät (Sowi. Fak.) 1976/77-2002/03
- Theologische Fakultät (Theol. Fak.) 1812-1880, 1899-1939/40
- Medizinische Fakultät (Med. Fak.) 1855-2003
- Naturwissenschaftliche Fakultät (Nawi. Fak.) 1975/76-2007/08
- Matrikelbücher aller Fakultäten SS 1894-SS 1967
- Matrikelbücher Juristen 1811- SS 1967
- Matrikelbücher Philosophie 1811- SS 1967
- Matrikelbücher Medizin 1865/66-SS 1967
- Matrikelbücher Theologie 1828-WS 1938/39
- Katalog über ausgetretene Schüler der Theologie 1828-1847
- Klassenverzeichnisse Philosophie 1808-1811
- Hörer der Landwirtschaft 1809-1823
- Hörer der Erziehungslehre 1814-1823
Theologische Fakultät
- Promotionen 1833-1997
- Rigorosenprotokolle 1827-1987
Rechts- und Staatswissenschaftliche Fakultät
- Promotionen Staatswissenschaften 1921-1977
- Promotionen Rechtswissenschaften 1827-1996
- Promotionen Rewi 1986-
- Rigorosenprotokolle für das 1., 2., 3. und 4. Rigorosum
Sozial- und Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät
- Promotionen 1968-1997
Philosophische Fakultät
- Doktoratsakten 1872-1990 (zu den online-Digitalisaten)
- Promotionen 1586-1680, 1823-1991
- Rigorosenprotokolle für das 1., 2. und 3. Rigorosum 1823-2003
- Lehramtsprüfungsakten (ca. 80 Laufmeter)
- Pharmazeuten: Sponsionen 1927-1971
Geisteswissenschaftliche Fakultät
- Promotionen 1991-1997
- Sponsionen ab 1977
Naturwissenschaftliche Fakultät
- Promotionen 1979-1997
- Sponsionen ab 1977
Medizinische Fakultät
- Promotionen 1865-1980
- Rigorosenprotokolle 1872-1998
- Akten der Ärztlichen Vorprüfung / Staatsexamen 1939-45
- Protokollbücher 1841-1955
- Hauptindizes 1863/64-1933/34
der Universitäten
- Basel
- Breslau/TH
- Brünn
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- Czernowitz
- Graz (zu den online-Digitalisaten)
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- Prag – Deutsche Universität
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- Wien – Akademie der Künste
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- Wien – Konsularakademie
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- Wien – Universität für Musik und Darstellende Kunst
- Wien – Hochschule für Veterinärmedizin
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