• Rektoratsakten: Jahresablage und Schriftverkehr des Rektorats (1802-1990)
• Ehrenbücher der Universität: 3 Bände (1895-1986)
• Personalakten (über 13.000 Akten)

• Philosophische Fakultät (Phil. Fak.) 1766-1791, 1802-1814, 1818-1879/80, 1882/83-1974/75, 1976/77-2009/10
• Juridische Fakultät (Jur. Fak.) 1809-2004/05
• Sozial- und Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät (Sowi. Fak.) 1976/77-2002/03
• Theologische Fakultät (Theol. Fak.) 1812-1880, 1899-1939/40
• Medizinische Fakultät (Med. Fak.) 1855-2003
• Naturwissenschaftliche Fakultät (Nawi. Fak.) 1975/76-2007/08

• Matrikelbücher aller Fakultäten SS 1894-SS 1967
• Matrikelbücher Juristen 1811- SS 1967
• Matrikelbücher Philosophie 1811- SS 1967
• Matrikelbücher Medizin 1865/66-SS 1967
• Matrikelbücher Theologie 1828-WS 1938/39
• Katalog über ausgetretene Schüler der Theologie 1828-1847
• Klassenverzeichnisse Philosophie 1808-1811
• Hörer der Landwirtschaft 1809-1823
• Hörer der Erziehungslehre 1814-1823

Theologische Fakultät

• Promotionen 1833-1997
• Rigorosenprotokolle 1827-1987

Rechts- und Staatswissenschaftliche Fakultät

• Promotionen Staatswissenschaften 1921-1977
• Promotionen Rechtswissenschaften 1827-1996
• Promotionen Rewi 1986-
• Rigorosenprotokolle für das 1., 2., 3. und 4. Rigorosum

Sozial- und Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät

• Promotionen 1968-1997

Philosophische Fakultät

• Doktoratsakten 1872-1990 (zu den online-Digitalisaten)
• Promotionen 1586-1680, 1823-1991
• Rigorosenprotokolle für das 1., 2. und 3. Rigorosum 1823-2003
• Lehramtsprüfungsakten (ca. 80 Laufmeter)
• Pharmazeuten: Sponsionen 1927-1971

Geisteswissenschaftliche Fakultät

• Promotionen 1991-1997
• Sponsionen ab 1977

Naturwissenschaftliche Fakultät

• Promotionen 1979-1997
• Sponsionen ab 1977

Medizinische Fakultät

• Promotionen 1865-1980
• Rigorosenprotokolle 1872-1998
• Akten der Ärztlichen Vorprüfung / Staatsexamen 1939-45
• Protokollbücher 1841-1955
• Hauptindizes 1863/64-1933/34

der Universitäten

• Basel
• Breslau/TH
• Brünn
• Budapest
• Czernowitz
• Graz (zu den online-Digitalisaten)
• Innsbruck
• Klagenfurt
• Lausanne
• Leipzig
• Lemberg
• Lemberg/TH
• Leoben
• Linz
• Linz Kath. Theol
• Padua
• Prag – Deutsche TH
• Prag – Deutsche Universität
• Prag – Tschechische TH
• Prag – Tschechische Universität
• Salzburg
• Wien
• Wien – Akademie der Künste
• Wien – Angewandte Kunst
• Wien – Konsularakademie
• Wien – Universität für Bodenkultur
• Wien – Universität für Musik und Darstellende Kunst
• Wien – Hochschule für Veterinärmedizin
• Zagreb